Потрясающий сеттинг у аниме, но почему то все говорят не смотреть второй ни в коем случае. Шта?
Скорее всего "все" имеют в виду вторую часть первой экранизации.
У манги 2 сериала: условно старый (Fullmetal Alchemist) и условно новый (Fullmetal Alchemist: Brotherhood).
Старый снимали до того, как автор закончила мангу, поэтому последняя примерно треть – студийная вольность (очень спорная).
Новый – соответственно идёт ровно по манге и заканчивается так, как задумывалось.

Старый сериал и его финальная арка – отнюдь не такие ужасные, как его красят. Просто на фоне масштаба Братства они там совсем затерялись. 

Если ты смотрел просто стальной алхимик, не братство (brotherhood), то поступай как советуют, начинай смотреть братство с самого начала.
Ежели ты итак его смотрел, то я не могу понять что там может быть не так, тем-более он вроде как не по сезонам идет сплошняком