"Не очень понятно, почему, например, Логан помог Циклопу избежать смерти в подростковом возрасте, но тот не узнал своего спасителя спустя несколько лет."

Потому что Циклоп не видел Росомаху? Весь процесс побега он провел в повязке, снимал её только чтобы выстрелить. В фильме куча разных ошибок, это не одна из них.