Места много занимает. Ну и в случае аварии (три раза тьфу) последствия ликвидировать проще будет.

А ещё, помимо того, что я товарищу писал про чувствительность и космические лучи, следует обратиться к истории. Тоннель рылся ещё для прошлого ускорителя, который был электрон-позитронным. А электрон-позитронные ускорители высокой энергии (>1 GeV, а там было в 100 раз больше) жутко много гамма-радиации излучают при работе.