Как вариант, могу предположить, что положение объектов (ну там в воздухе заспавнился) может неправильно о рабатыватьчя как раз из-за больших сейвов или вроде того. Когда движок не успевает / неверно интерпреиирует какие-то данные

Вот как раз в играх бесезды от сейвов много чего зависит. Летающие персонажи нет, а вот глючащию персонажи или даже просто банально невозможность загрузится - это да.