только один раз, когда оказывается, что Алиса тоже андроид, нам дают выбор: отказаться от ведущего мотива или принять реальность.

Кэра всегда знала, что Алиса - андроид. В самом начале истории Кэры, когда она (мы) убирается, она роняет с комода журнал, поднимает и рассматривает его (но для игрока видна только задняя сторона).
Это потом игроку во флешбеке показывают, что этот журнал был описанием к андроиду-ребёнку Алисе. Кэра-то всё знала с самого начала