Есть предположение, что в следующим DLC мы и будем как раз заниматься уничтожением этого "Микоси" аka "Душегуба" для освобождение всех заточённых в нём человеческих сознаний. Ведь именно только по такой логике можно остановить процесс превращения Ви в Джонни, поскольку именно этот Душегуб отдаёт "приказы" биочипу, который в нас встроен.

Это один из первых вопросов, которые я задал сам себе после прохождения ветки Вудуистов. Тоже не понимаю этот момент, но мне кажется, что там всё же есть какие-то нюансы. К примеру, если не искать ответа в лоре игры, то можно предположить, что эти искины сами создали для себя эту среду обитания, которая находится за гранью нашего понимания. Как "живой" пример - Альт, которой как человека уже давно нету, но она всё равно существует в своём мире, или Делаймейн, в одной из возможных концовок его линии заданий (доступной только с интеллектом 10+), отделяется от своего основного ядра, и становится чем-то независимым, свободным, на подобии человеческого разума, процессы которые тоже есть за гранью нашего понимания.  

Так же, исходя из твоего коммента, можно предположить, что за всем этим стоит какой-то гос. заговор для полного контроля сознания каждого человека на планете, или что это всё-таки так называемый Микоси, за создание которого стоит сама Арасака. Вот х*й знает, реально)

Вопрос это не новый. Есть популярный ответ - в мире киберпанка серверная инфраструктура так развилась и вируализировались, что фиг поймешь какие контейнеры/лямбды в каких виртуалках крутятся на железе автомата для продажи конфет.
Процессоров так много, что произошел качественный скачок и понять на каком именно железе исполняются дикие искины не возможно. Они и сами могут этого не понимать.