Главным протагонистом новой части стал полубританец-полуиндеец Радунхагейду, также известный как Коннор. По характеру он — человек задумчивый, эмоциональный, а также преданный идеалам свободы, равноправия и справедливости. В отличие от Альтаира и Эцио он присоединился к Ордену только ради того, чтобы спасти родную деревню.

События Assassin’s Creed III происходят во время Войны за независимость США. Обширные леса и мелкие поселения пришли на смену большим городам в качестве главной составляющей игрового мира.

Механики погодных эффектов и смены времён года сделали взаимодействие с окружением и NPC более интересным. По земле герой и враги ходят с нормальной скоростью, а вот толстый слой снега их замедляет. То же самое касается дождя и тумана.

Боевые суда стали одним из наиболее крупных нововведений в игре. Раньше ассасины нападали исключительно на суше или с воздуха. Теперь же у них появилась возможность выходить в море и там давать отпор врагам.

В отличие от предшественниц, Assassin’s Creed III поощряет агрессивную тактику ведения боя. В противоположность Альтаиру и Эцио, предпочитающим убивать скрытно, Коннор действует жёстко и в открытую.

Отдельные элементы игрового мира также претерпели изменения. Увеличилась роль в сюжете побочных заданий, связанных базой, а NPC стали больше похожи на живых людей.

Наконец, появилась система охоты и возможность продавать мясо и шкуры убитых животных.