События разворачиваются в новом регионе Альмия, расположенном недалеко от Фиоре. Игра начинается с того, что персонажу игрока приходится выполнять пробный захват на Пикачу. После выполнения захвата персонаж игрока входит в школу рейнджеров - школу, которая обучает покемонов, рейнджеров, операторов и механиков. После чего происходит знакомство с нашим классом. После чего следует экскурсия по школе и встреча с инструкторами по захвату Капана и Клэр. Так же в эту ночь предстоит пройти тест мужества или же обряд посвящения, который придуман самими студентами, где ему предстоит собрать четыре стайлера(прибор рейнджера для поимки покемонов) из разных частей школы и принести их в переднюю часть лаборатории в подвале. После завершения задачи, не успевая уйти, мы попадаем в засаду к Гастли. После того как персонаж игры захватывает его, он и Кит попадаются строгому учителю.