Ну тут тебе самому разбираться надо. 
Для начала через MSI Afterburner и Rivatuner выведи всю статистику. Во время лагов смотри не происходят ли аномалии с температурами/питанием/частотами/и т.д.
Потом попробуй поотключать перифирию. Все юсб устройства по очереди, даже интернет кабель. Дальше уже аналитически думай на каком этапе/с какими симптомами происходит эта проблема