Это потому, что разработчики зачастую делают так, что доигрывать сайд-квесты после завершения основного сюжета нельзя/неуместно/неинтересно.

Это проблема гейм-дизайна. И она встречается достаточно часто.

А должно быть так:
Ты играешь игру, выполняя задания в любом количестве и порядке, и не боишься что-то упустить из-за "неправильной последовательности" выполнения.
Ведь в этой игре все-равно всегда доступен, и актуален (!), весь контент.

Просто играешь так как тебе нравится, и столько сколько тебе нравится. Но такие игры редкость.