Использую Notion для заметок, чек-листов, списков. Очень удобный, гибкий, многофункциональный (можно составлять всякие таблички с автоматическим подсчетом значений, сортировками и фильтрами). У него есть десктоп клиент (но я пользуюсь в браузере), мобильные приложения для iOS, Android, офлайн доступ к заметкам, импорт из Evernote (кстати дарят 5$ на счет, если сделаешь его). Для организации тысяч заметок подойдет (в нем вообще можно составлять целые базы данных/знаний и даже кто-то умудряется делать там полноценные сайты). Скорость работы на мой взгляд могла быть быстрее у Notion, плюс тут еще играет фактор количества заметок, но меня устраивает.

Для более простых заметок (типа списка покупок в супермаркете) использую Google Keep.