Расширения не могут взаимодействовать (изолированы) со страницами chrome://, других расширений и магазина Chrome, поэтому Dark Reader не окрашивает Настройки и страницу этого расширения «новой вкладки», у которого в стилях изначально прописан белый фон страницы, до прогрузки картинки (или самой страницы, если это фрейм). Так что это проблема расширения, к сожалению.

Существует ещё другая проблема, но не относится к этому посту: многие тёмные темы меняют фон встроенной «новой вкладки» и шапки, но забывают сменить фон «пустой страницы» и при открытии каждой новой вкладки происходит «вспышка».

Наверное уже не актуально. Я слоупок, извините.