"Любовь" Нео к Тринити и в обратную конечно максимально незрелая, ожидал скрещивание человека с машиной через Тринити на манер Масс Эффекта и, возможно, вывода про то что им не надо быть вместе, как в Хэнкоке.

И да - вообще непонятна мотивация тех кто помогает Нео доставать Тринити нарушая мир с роботами, будто этот мир ничего не стоит.