Весь инвентарь и менеджер навыков перенесли в виртуальный смартфон Кирю (своеобразная реклама Sony Xperia XZ). Самое главное — наконец-то привели в порядок систему побочных заданий. Во многих частях серии приходилось обегать весь район в поисках нового квеста. В Yakuza 6 все побочные задания появляются в импровизированном блоге Troublr, на который всегда можно зайти через мобильник Кирю. Выбранные квесты получат отметку на карте города.