Brutal Duke Nukem 3D добавляет в игру ещё больше жестокости, увеличивая количество крови и связанные с ней эффекты, например, различные брызги на стенах и потолке, её «распыление», а также звуки. По словам авторы мода, всю работу он сделал сам, используя при этом различные спрайты из оригинала и других игр.