"Единственный момент, столкнулся с особенностью: версия Director's Cut конфликтует с русификаторами из сети, так как они ставятся как мод, а игра не дает запускать моды с модифицированным .exe файлом."

Ну это можно обойти, правда немного геморно. Нужно:
1. Распаковать архивы игры инструментом Gibbed.DeusEx3.Unpack из Gibbed Tools (https://www.moddb.com/downloads/gibbeds-deus-ex-hr-tools);
2. Аналогичным образом распаковать архив RUSSIAN.000 из папки mods;
3. Скопировать все содержимое распакованного архива RUSSIAN.000 в распакованные архивы игры (с заменой файлов) кроме файла bigfile.xml;
4. Открыть любым текстовым редактором bigfile.xml из распакованных архивов игры и этот же файл из распакованного архива RUSSIAN.000;
5. Из файла bigfile.xml от архива RUSSIAN.000 скопировать все строки после <!— FFFFE200 = Russian, UnusedFlags —> до <!— FFFFFF60 = Russian, UnusedLanguages, UnusedFlags —> в файл bigfile.xml из архивов игры в аналогичный его раздел (находим там строку <!— FFFFE200 = Russian, UnusedFlags —> и вставляем под нее; таких строк там много, можно вставить в любую);
6. Упаковываем распакованные архивы инструментом Gibbed.DeusEx3.Pack;
7. Заменяем родные архивы теми, что получились (их будет на один больше).
8. Папку mods и ее содержимое можно удалить. Игра при запуске будет ругаться, что не может использовать моды - игнорируем это сообщение.
9. PROFIT!

Смысл проделанных действий - добавить в архивы игры недостающие аудиофайлы русской озвучки и прописать пути к ним, чтобы игра их находила при срабатывании триггеров.