{"id":2712,"title":"\u0422\u0435\u0441\u0442 \u0441 \u0448\u0438\u0444\u0440\u0430\u043c\u0438 \u0438\u0437 \u0435\u0434\u044b: \u043d\u0435 \u043f\u0440\u043e\u0445\u043e\u0434\u0438\u0442\u0435 \u043d\u0430 \u0433\u043e\u043b\u043e\u0434\u043d\u044b\u0439 \u0436\u0435\u043b\u0443\u0434\u043e\u043a","url":"\/redirect?component=advertising&id=2712&url=https:\/\/tjournal.ru\/special\/kaleidofood&placeBit=1&hash=28db11ae3219937c44aa1427c824eab338831a6e3433f41ae22d24d5717c4772","isPaidAndBannersEnabled":false}
Жизнь
Yuriy Svidinenko

Как я помог исследователям увидеть тот самый коронавирус

Та самая модель SARS-Cov-2 Юрий Свидиненко

Так получилось, что моя основная деятельность сейчас – создание и анимирование 3D моделей в биотехе, фармацевтике и медицине. И за прошлый год у меня был ряд интересных проектов, связанных с печально известным SARS-CoV-2 или, проще – коронавирусом.

Итак, больше года назад я познакомился с одним стартапом из Y-Combinator и вместе с учеными из института Скриппса в Сан-Диего мы собрали первую приблизительную более-менее точную 3D модель коронавируса. Его, как раз, вы можете увидеть на заглавной картинке.

Мы восстановили точную структуру спайк-белков, полностью смоделировали их количество, размеры, сайты гликолиза (если кому интересно). Оставили более поверхностно проработанные мембрану и белки поверхности.

Мы обработали много фоток со сканирующего электронного микроскопа для того, чтобы определиться с формой вируса, количеством белков, их расположением, потому что корона - не самый симметричный и правильный вирус, как, например, вирус герпеса. Также работали с публикациями тех самых ученых из Уханя, которые его первыми описали.

Все эти данные мы перегнали в 3D в виде полигонов и точек и потом собрали в Cinema4D. Потом с помощью Redshift 3D + AE визуализировали сразу в виде анимации механизма действия – как вирус проникает в клетку, и в виде иллюстраций.

Было это в феврале 2020 года, перед началом локдауна. После этого достаточно много стартапов и ученых использовали эту модель как в видео, так и в презентациях. И благодаря таким детальным видео инвесторы смогли дать бюджеты нескольким стартапам, которые сделали ряд продуктов по борьбе с коронавирусом. Сейчас эти лекарства в активной разработке. Сред них – ингалятор, который на ранней стадии заболевания может снизить содержание вируса в носоглотке на 95%!

Получил неделю назад печатную версию и очень рад!

И вот сейчас уже хочу похвастаться - через год вышел печатный альманах ассоциации медицинских иллюстраторов AMI – каталог мировых достижений в области медицинских визуализаций, и там мою модель и ее представление выбрали как одну из достоверных для трибьют-секции по обзору работ с коронавирусом. Этот журнал - такой печатный аналог Nature в моей индустрии.

Работа с ним еще не закончена, сейчас мы работаем над визуализацией модифицированного вируса и ряда РНК-вакцин, которые будут с ним бороться.

Ну и, конечно, буду рад ответить на вопросы по технической части (по 3D или по биологии), если у кого-то они есть!

0
184 комментария
Популярные
По порядку
Написать комментарий...
Yuriy Svidinenko

Спасибо большое всем за комментарии!

Я постараюсь написать еще пост о том, как пришел в визуализацию - там было много интересных судьбоносных поворотов, которые я сначала и не мог осознать толком.

И вот для тех, кто хотел покрутить модель - проект в C4D самого вируса: https://www.dropbox.com/s/duerj2s93pa8yi3/C4D_SARS_CoV_19.zip?dl=0

Ответить
Развернуть ветку
Александр Подгорный
Ответить
306
Развернуть ветку
I forgot password again

Огонь! Интересная штука, о которой я раньше и не задумывался "а откуда, собственно, берутся изображения вирусов" стала чуть более понятна)

Очень круто!

Ответить
113
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Спасибо!

Ответить
48
Развернуть ветку
revolver ocelot

Юрий, а на чем рендерили - на видеокарте или процессоре?
Интересно какое железо требуется для такого проекта.

Ответить
0
Развернуть ветку
AndrT

Не из блендера. Гугли электронный микроскоп

Ответить
2
Развернуть ветку
Молодой химик

Судя по статье именно что из блендера.

Ответить
4
Развернуть ветку
ShizZ

изображения разные бывают. разноцветные и подробные - естественно рендерятся.

что не отменяет фотографии с электронного микроскопа

Ответить
0
Развернуть ветку
Zero Itsed

Очевидно не отменяет, ведь даже автор пишет, что они обрабатывали изображения с электронного микроскопа)

Ответить
0
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

И вот одно из этих изображений, кстати!

Ответить
21
Развернуть ветку
RedApple

Ого, а можно узнать, какого приблизительно размера вирус?

Ответить
2
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Он кстати не маленький - от 60 до 140 нанометров. То есть по его диаметру можно расположить от 4 до 10 транзисторов Intel по 14-нанометровому техпроцессу.

Ответить
26
Развернуть ветку
Alexander

Ну да, у китайцев техпроцесс отстает :)

Ответить
23
Развернуть ветку
Boruh Zackelberger

Ну слили пререлизную версию вроде.. Или нет?

Ответить
0
Развернуть ветку
Arekanderu

по его диаметру можно расположить от 4 до 10 транзисторов Intel по 14-нанометровому техпроцессу
Чипированию быть!

Ответить
0
Развернуть ветку
Донкий ХОД

А более детальных фотографий с ЭМ нет, это максимум разрешения?

Ответить
0
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Более детальные только с кристаллографии. И то по частям.

Сюрприз, но у электронов тоже есть длина волны! А вот у рентгеновского излучения она намного меньше, поэтому им хорошо изучать белки, молекулы, все маленькое. А STM дает представление как это все собрано вместе.

Ответить
5
Развернуть ветку
Донкий ХОД

Да я это прекрасно понимаю, собсно поэтому и спрашиваю - предел или нет. Потому что то в новостях пишут, что чуть ли не фото отдельных атомов в решетке получили, а тут вирус качественно снять не могут. Вообще есть более детальные фото этой дряни, неважно чем сделанные?

Ответить
0
Развернуть ветку
Dimasik

Какая маленькая залупа, но такая вредная при этом...

Ответить
1
Развернуть ветку
Boruh Zackelberger

Скорей всего и это созданное программным обеспечением микроскопа изображение (convolution filtering, преобразования Фурье итд). Сырые данные с датчика выглядят немножко стремнее.

Ответить
1
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Мы обрабатывали в разрезе морфологии - то есть размеров, соотношения спайк белок-мембрана вируса, количества спайк белков на одну единицу, размер и вид капсида вируса.

Ответить
5
Развернуть ветку
Ефим Тунев

Ничего не понятно, но ОЧЕНЬ интересно.

Ответить
6
Развернуть ветку
I Need Potato

Может из Cinema4D?

Ответить
1
Развернуть ветку
Texlama

Сразу видно dude не читал, сразу перешёл в комментарии)

Ответить
1
Развернуть ветку
Эмиель Регис

А мог бы в игры играть, или там киберспортсменом стать, или на площадку выйти и стать олимпийским чемпионом. Эх, Юрий, жизнь на такую фигню положили!

Шучу, естественно. Красавелльный красавец, так держать! В смысле: успехов в любых начинаниях, продолжаниях и заканчиваниях. Умные и талантливые люди должны спасать этот мир — ну, чтоб хоть кто-нибудь.

Ответить
56
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Да уж, чемпионом по плаванию я не стал, просто КМС =) и в диаблу 2 играю тоже как любитель, так что приходится работать с тем, что получается лучше всего.

Ответить
42
Развернуть ветку
Semen malovik

Это очень круто, когда находишь свой путь! Желаю дальнейших успехов!

Ответить
11
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Спасибо!

Ответить
7
Развернуть ветку
Борис Губанов

А откуда берется цвет, в данном случае, коронавируса? Берется из головы?

Ответить
10
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

В большинстве случаев, конечно, из головы. На таком уровне нет самого понятия цвет, так как это конструкт головного мозга, базирующийся на взаимодействии фотонов разной энергии с клетками сетчатки. То есть что-то в принципе искусственное.

Мы стараемся подбирать цвета так, чтобы было ощущение погружения в микромир и параллели с нашим миром. Например, хлоропласты в растительных клетках почти всегда зеленые, это связано с их спектром поглощения.

Но в целом там, где атомы - есть только спектры испускания и поглощения, а не цвета.

Ответить
96
Развернуть ветку
splinefx

А как строится изображение в электронном микроскопе в данном случае? Просто воссоздается какая-то структура, без цветов и прочего?

Ответить
16
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Это хороший вопрос! Вкратце на сканирующем туннельном микроскопе все опыляют атомами серебра, они хорошо проводят электричество. Потом двигают кончик микроскопа по площади всего образца и снимают ток туннелирования - по нему виден ландшафт образца. И в зависимости от тока можно понять, с каким материалом имеешь дело.

Можно подробнее почитать - в интернете много чего есть про микроскопию, и все интересное.

Например, сейчас передовая криотом-микроскопия. Вот она реально крутая!

Ответить
75
Развернуть ветку
Facenapalm

Мне всегда казалось, что при определённом приближении изображение становится чёрно-белым.

Ответить
2
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Да, плюс еще хроматическая аберрация, это если смотреть в оптический микроскоп. Вообще все цвета препаратов - от окрашивания, чтобы отделить части препарата друг от друга.

Ответить
4
Развернуть ветку
Mark Grey

https://www.youtube.com/watch?v=qSHK7NIk8h4&ab_channel=Droider.Ru

Тут доступно объясняют принцип работы микроскопа

Ответить
1
Развернуть ветку
Tom Veidt

"так как это конструкт головного мозга, базирующийся на взаимодействии фотонов разной энергии с клетками сетчатки" с какой-то стороны да, но с другой мы уже давно вычислили все длины волн для цветов и можно не видя что-то но зная длину волны отражения сказать какого оно цвета и глаза тут не нужны вообще. Собственно так комические фото и раскрашивают по данным с радиотелескопов. Тут так не прокатит что-ли? Или диапазон цветов у разных соединений углерода в организме очень узкий и получится одноцветное фото?

Ответить
1
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Ну вот я уже писал, что все атомы разные и спектры разные, мы просто можем принять, например, по спектру рассеивания, что вода будет бело-голубая, а гемоглобин - красный. И так примерно выводится палитра всех цветов.

Плюс еще есть исторически сложившаяся палитра у медиков, которую уже менять бесполезно.

Ответить
7
Развернуть ветку
Bill Bill

Это зависит от того, какого цвета рентгеновские лучи. Цвета боли, я полагаю.

Ответить
2
Развернуть ветку
Demian

Это что, в фильме "Осмосис Джонс" соврали получается?

Ответить
0
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Да!

Ответить
0
Развернуть ветку
Отвали Лягуха

Рад за тебя :) Молодец!

Потом с помощью Redshift 3D + AE визуализировали сразу в виде анимации механизма действия – как вирус проникает в клетку, и в виде иллюстраций.

А где анимацию можно посмотреть?

Ответить
9
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko
Ответить
70
Развернуть ветку
Отвали Лягуха

Спасибо! Надо было сразу в новость добавить, многим было бы интересно посмотреть)

Ответить
22
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Да, что-то я об этом не подумал - спонтанно написал пост, думал мало кому будет интересно.

Ответить
5
Развернуть ветку
Sir Vellovich

Да ну как же "мало кому будет интересно". Я как раз, когда в посте прочитал про анимацию, думал о, ну щас гляну в конце, а там нема :(
Сколько нам про это говорят из каждого утюга, что де вирус, он опасный, легко проникает. А вот увидеть этот процесс своими глазами - другое дело.

Ответить
0
Развернуть ветку
Виктор Омай

криповая музыка

Ответить
1
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Под стать главному герою =)

Ответить
2
Развернуть ветку
Devil Bug

Напомнило тайную жизнь клетки, очень красиво

Ответить
1
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Да, мы во многом ими вдохновляемся в работах, кстати тоже знаком с XVIVO лично.

Ответить
1
Развернуть ветку
Maxim Gursky

Потрясающе!

Ответить
0
Развернуть ветку
by. eura

Очень даже впечатляет

Ответить
0
Развернуть ветку
Ivan S.

Вижу огромная работа проделана, спасибо! Что заметил что камеру нужно успокоить и ease in out на ключевые кадры... Чересчур дёргается и не естественно не плавно двигается. Как будто студент делал впервые освоив 3д анимацию.

Остальное всё прекрасно. Благодарю!

Ответить
0
Развернуть ветку
Молодой химик

Автор молодец и красавчик.
Оч круто видеть результаты своих работ.

Вопрос: есть всякие разные штаммы и тд. У них есть различия "во внешности"? Или чисто прошивка.

Ответить
16
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Если один вид вируса - то разница в белках может быть. Так, например, вариант дельта от обычного отличается. В сканирующий микроскоп разницу не увидишь, а вот рентгеноструктурный анализ покажет небольшую разницу в белках. Ну и внутрення РНК, естественно, чуть отличается.

Ответить
31
Развернуть ветку
Kairo

Было бы очень интересно увидеть пост о том как автор пришёл в биотехнологии. Интересная же сфера)

Ответить
9
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Это долгая история, конечно. Если интересно, то думаю через неделю смогу написать. Сначала был инженером по электроприводу и работал на доменных печах. Потом - по сантехнике и отоплению, сейчас - по визуализации биотеха и медицины, и осваиваю computer vision + data science для будущего стартапа.

Ответить
47
Развернуть ветку
Alexander Sol.

Будет очень интересно прочитать, подпишусь)

осваиваю computer vision + data science
А на какой платформе осваиваешь? Программирование ещё с предыдущей занятости помогло, или с нуля учить пришлось?

Ответить
1
Развернуть ветку
Sir Vellovich

Да-да! Напишите, пожалуйста. Вообще, впечатляюще извилистый путь к CG биотеху )

Ответить
0
Развернуть ветку
Иван Куренский

Пишите всенепременно!

Ответить
0
Развернуть ветку
Mikhail Voloschuk

Пришел домой - сидит. Не знаю кто это, но по глазам вижу - рад мне...

Ответить
10
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Это наши знакомые коллеги индусы нарисовали =) Индустрия маленькая, мы все друг друга знаем.

Ответить
19
Развернуть ветку
Станислав Петров

Красивое

Ответить
5
Развернуть ветку
Аркадий Акакиевич

- Вы вирусы уничтожаете?
- Нет, только показываем

Ответить
23
Развернуть ветку
Bigtiger

Поздравляю.
А по остальному - есть ли малейшие признаки, что компанию Холмс задушили республиканские фармацевтические гиганты ?

Ответить
4
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Theranos? Они мошенники, я об этом знал еще пару лет назад. У них даже прототипа рабочего не было.

Ответить
19
Развернуть ветку
Bigtiger

Каррейру я тоже читал. Но всё выглядит просто невероятно.

Ответить
5
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

У нас много знакомых, у которых реально все круто, но надо быть PhD чтобы это понять. Обычно то, что круто для широкой аудитории, нереально или уже было сделано 50 лет назад.

Ответить
8
Развернуть ветку
Bigtiger

Невероятно - в смысле обмана. И масштаба личностей инвесторов.

Ответить
4
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Они там очень сильно подделывали результаты на старте. Прямо фальсифицировали на старте, думали сделаем по стратегии fake it until make it, но сделать как обещали у низ не вышло.

Как бы тут в США такой менталитет, что тебе будут первый раз верить, не будут сомневаться.

Инвесторы и подумали, что у них действительно крутая технология, не думали, что можно так нагло врать.

Обычно в научном сообществе если ты что-то говоришь, то тебе верят, потому что не принято обманывать.

Ответить
19
Развернуть ветку
Владислав Коваленко

Ну все же странно, что не проверили. Обманывать может и не хотят, но могут ошибаться в расчетах. На доверии немного странно в таких сферах что-то выстраивать. Тут же не просто деньги, а еще и жизни людей. То есть если инвестируешь в фейк, то другой проект, который мог спасти много жизней отваливается автоматом.

Ответить
0
Развернуть ветку
Антон Недоцуков

Индустрия стартапов так и работает - инвестируют в компанию, у которой пачка рисунков на салфетке и питч на 10 минут, пока не перехватили инвестиционные конкуренты. Выстрелит - хорошо, не выстрелит - в утиль и отыграться на другом стартапе.

Ну а дальше, как и сказали выше, у джентльменов принято верить на слово.
И верить могут в очень больших количествах:

Ответить
4
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Ну ошибиться в расчетах это одно, главное что ты веришь в идею и хочешь добиться результата. А в процессе работы может даже идея стартапа поменяться, может быть слияние с другой компанией, главное работать.

В случае с Theranos идея была одна - собрать побольше денег и уйти в закат.

Ответить
2
Развернуть ветку
Jhon Dou

Как в анекдоте , вот тут мне карта и пошла. :)

Ответить
0
Развернуть ветку
Andriy Shkrobut

Юрий, а можно по-подробнее про PhD. Имелось ввиду что именно в этой сфере нужно быть PhD, или в целом чтоб крутые штуки понимать и делать? Просто интересен взгляд на образование.

Ответить
1
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Просто специфика информации настолько сложная, что можно не понять сразу о чем речь вообще. Надо хорошо ориентироваться как в биологии, так и в клинической медицине, чтобы понимать насколько важное нововведение предлагает очередной стартап.

Например работу и полезность того же CRISPR до сих пор многие не понимают несмотря на его популяризацию.

Можно прочитать заголовок в стиле "Ученые победили рак" и там будет полная ахинея, а можно прочитать "Ученые смогли превращать сенильные клетки в плюрипотентные" и это будет переворот в медицине.

Ответить
3
Развернуть ветку
Mr Hyde

Плюрипи..., плюрипор..., плюрипиро..., ..., ..., плюри-по-тент-ные! Лишь с 10-й попытки смог я правильно произнести!

Ответить
–1
Развернуть ветку
Антон Недоцуков

А что невероятного? Как будто мало было в мировой истории умельцев рассказывать, что у них есть нечто и собирать на это капусту.
Сходу вспоминается Виктор Люстиг, умудрившийся "продать" Эйфелеву башню (дважды), вот где больше подходит определение невероятно.

Ответить
9
Развернуть ветку
Михаил Мезенцев

В Малину не поздно инвестировать?

Ответить
0
Развернуть ветку
Тимур Есенбаев

Это которые из китайского робота-поклейщика собрали "прототип" анализатора крови? :D "джобсы" от мира биотеха

Ответить
0
Развернуть ветку
Административный космос

Комментарий удален по просьбе пользователя

Ответить
8
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Спасибо!

Ответить
5
Развернуть ветку
Молодой химик

Белок на видео такой марионетка! Неужели он даже не пытается сопротивляться? Не могу поверить, что мой организм вот так просто разложил белок тут и там и даже не поставил охрану вокруг него, это ж кто угодно может прийти, изваляться в нем и убить меня?

Ответить
5
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Вот тут сопротивляется - антитело блокирует вирус:

Ответить
9
Развернуть ветку
DDD
Ответить
6
Развернуть ветку
Молодой химик

Антитело такое маленькое, но красивое ♡
Замечательный проект вы создали, наглядно показывает как все устроено, очень интересно и полезно, спасибо)

Ответить
4
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Спасибо!

Ответить
2
Развернуть ветку
ShizZ

там столько охраноидов вокруг плавает, на всякое непонятное резко агрящихсятся - что все в целом норм, иначе мы бы не жили ,))

и кстати да - мрет народ не от короны а от специфического имунного ответа, который иногда оказывается неадекватным и черезмерным.

Ответить
7
Развернуть ветку
Молодой химик

Цитокиновый шторм? Бывает, да, но умирают в основном все-таки от пневмонии - легких просто не остается.

Ответить
2
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Да там все поражается, и как бонус от высокого жара начинается фибороз клапанов сердца или артрит в будущем. К сожалению заболевание очень для людей нехарактерное, поэтому столько побочек и долгое восстановление.

Ответить
3
Развернуть ветку
Boruh Zackelberger

там сбалансированная комбинация многих факторов:

1) атипичность пневмонии не позволяет выявить симптомы на ранних стадиях,

2) поражения легких рубцуются, альвеолы уничтожаются, ткань выводится из процесса насыщения крови кислородом,

3) цитокиновый шторм, как контрольный выстрел в тяжелых случаях;

Нейротоксическое поражение (неадекватная самооценка и поведение в тяжелых стадиях, депрессия после снижения вирусной нагрузки, потери нюха и вкуса) как вишенка на торте. В скобочках перечислены только выявленные эффекты, а какие там поражения в долгосрочной перспективе - хз.

Ответить
2
Развернуть ветку
Gorynych

Образ напомнил это. Кто-то в нашем теле играет в Дум. :)

Ответить
7
Развернуть ветку
Молодой химик

—> pikabu.ru

Ответить
–49
Развернуть ветку
Alexander Shimanskiy
Ответить
10
Развернуть ветку
Бумажный Теоретик

Определенно апвоут. Красивая работа!

Ответить
5
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Спасибо!

Ответить
3
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Спасибо огромное всем за комментарии и поддержку!

Честно говоря, не ожидал такого обсуждения, но рад рассказать больше о своей работе!

Я постараюсь всем и завтра ответить, так как у меня сейчас уже ночь.

Ответить
5
Развернуть ветку
Alex Pushilin

там наверху уже писали, но я присоединюсь - было бы очень интересно узнать как приходят в такую профессию

Ответить
1
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Да, сделаю пост в течении пары недель, как с проектами разгребусь!

Ответить
0
Развернуть ветку
MegaGazon

Мне вот что интересно. А как узнаётся сама "толщина" клетки вируса. Ну тип, размер. Ведь они же не все одинаковых размеров. Одни больше, другие меньше? Это определяется под микроскопом или нет?

Ответить
0
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Да, все данные такого рода получают от данных микроскопии. Там видна не только первичная структура, но и размер относительно клеточной мембраны. И да, все вирусы разного размера.

Более точно их структуру узнают методами рентгеновской кристаллографии.

Ответить
15
Развернуть ветку
vitaliy

А есть "фото" с самого микроскопа? Хотелось бы посмотреть с чего всё начинается

Ответить
0
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Один из вариантов вот такой

Ответить
0
Развернуть ветку
vitaliy

Не, я имел ввиду изображения на основе которых моделька сделана)

Ответить
0
Развернуть ветку
Romanoss

Звучит так будто бы ты работаешь в амбрелле и разработал логотип для вируса 🤔

Ответить
3
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Это все протомолекула шалит!

Ответить
4
Развернуть ветку
s23ver

Хм.. боюсь спросить.. Какой вирус твой любимый..?? Я про 3D модель конечно-же..))

Ответить
2
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Наверное это герпесвирус. Он наиболее математичный, симметричный и, наверное, первый, который я смоделировал и нарисовал.

Ответить
5
Развернуть ветку
Алексей Разумовский

Что такое сайты гликолиза и спайк-белки, в кратце

Ответить
0
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Спайк-белки это шипы короны, благодаря которым и назвали сам вирус. На картинке они розово-красного цвета, торчат во все стороны.

Сайты гликолиза - такие активные участки на поверхности этих шипов, благодаря которым они связываются с рецепторами на клетке или же с блокирующими их антителами.

Ответить
8
Развернуть ветку
AndrT

А что внутри коронавируса? Этой сферы

Ответить
0
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Там очень плотно запакован его код - молекула РНК.

Ответить
13
Развернуть ветку
Здешний Филипп

Комментарий удален по просьбе пользователя

Ответить
3
Развернуть ветку
Музыкальный чайник

Комментарий удален по просьбе пользователя

Ответить
2
Развернуть ветку
Roman Rzaev

Так же интересно почему не любят форсить тему что среди курильщиков и астматиков очень низкий процент заболевших, есть какое то понимание механизма ?
а статистика есть?
Не, я не из вредности спрашиваю.

Ответить
1
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Да, в этом есть рациональное звено. Дело в том, что если на поверхности клетки нет ACE2 рецепторов, то вирусу не будет за что зацепиться. У курильщиков их очень мало, поэтому у них вирус меньше размножается.

Это пока малопроверенные данные, но они есть. И да, это не пропаганда курения =)

Ответить
8
Развернуть ветку
Музыкальный чайник

Комментарий удален по просьбе пользователя

Ответить
0
Развернуть ветку
Музыкальный чайник

Комментарий удален по просьбе пользователя

Ответить
6
Развернуть ветку
RusUpdate

Любопытная инфа

Ответить
1
Развернуть ветку
Basil Titovchenko

Почему тема стала табу, понятно — ведь это идёт вразрез с антитабачной пропагандой. Свежих данных действительно не найти, а старые материалы в основном неловкие попытки не уклониться от генеральной линии о том, что курить — вредно. Курить действительно вредно, спорить глупо, но у любой палки есть два конца...

Ответить
0
Развернуть ветку
AndrT

"Сред них – ингалятор, который на ранней стадии заболевания может снизить содержание вируса в носоглотке на 95%!" - ага, местамидин называется, и ему уже 100 лет в обед

Ответить
2
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Да, очень похожий механизм действия, только активный агент у них другой.

Ответить
3
Развернуть ветку
AndrT

И на ipo с местамидином не выйдешь, а со стартапом запросто! Инвестор - не мамонт, как говорится.

Ответить
1
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Более того, скорее он до сих пор запатентован и кому-то принадлежит. Так что стартапы позиционируют себя как что-то новое, несмотря на то, что есть и старые аналоги.

Но, возможно, у нового ингалятора будет выше клиническая эффективность.

Ответить
1
Развернуть ветку
AndrT

Да чушь это всё, надо вырабатывать коллективный иммунитет, а не ингаляторы скупать. "Спрятаться" или отгородиться всякими антисептиками от вируса это плохая идея.

Ответить
–1
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Скорее всего, что коллективный иммунитет к этому вирусу не удастся выработать даже через сто лет. Так что поможет только вакцинация, ежегодная ревакцинация и лечение при первых симптомах такими антисептиками или же молнупиравиром.

Ответить
1
Развернуть ветку
Evil Spirit

Недавно статья вышла о том, что эффективность ревакцинации сомнительна 🤔

Ответить
0
Развернуть ветку
Alexander Benkendorf

Подскажите а где подробнее про местами дин и ковид почитать?
И как на практике это работает.
(особенно про то когда ранняя стадия, ведь это фиг поймёшь)

Ответить
1
Развернуть ветку
Easy Rider

На практике подобная визуализация как-то помогает в исследовании? Или подобное нужно для общего понимания?

Ответить
1
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Да, очень помогает для понимания метаболических путей и трехмерной структуры. Особенно помогает для разговора с инвесторами, если это надо. Им непонятна молекулярная биология.

Ответить
6
Развернуть ветку
2BrokerZIP

В зависимости от трехмерной структуры меняется биохимическая активность компонентов вириона. Так что да, визуализация определенно помогает в разработке лекарственных средств

Ответить
1
Развернуть ветку
Иван Иванов

теперь с вирусом спида тоже самое нужно сделать, до сих пор никто его не видел (специально для тупых - это шутка)

Ответить
1
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Австралию тоже мало кто видел ;)

Кстати мой коллега нарисовал охренительный вирус спида, правда абсолютно некорректный, зато очень эмоциональный.

Ответить
6
Развернуть ветку
Макс Фомин

Ты сделал наш мир чуточку лучше. Спасибо!

Ответить
2
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Спасибо, в планах есть сделать еще лучше =)

Ответить
0
Развернуть ветку
Максим Ghostb

Очень приятно видеть успехи коллеги, пускай и из другой области применения 3D искусства. Молодца!

Ответить
2
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Спасибо, коллега!

Ответить
0
Развернуть ветку
Миша Лоев

Здорово!

Еще вот оставлю здесь ссылку на другую работу (не в смысле сравнения) по моделированию

Анимация: https://visual-science.com/ru/projects/sars-cov-2/animation/

(ну, там и картинки есть, если что)

Ответить
2
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

О да! Это отличный пример по его структуре - тут все честно, даже внутренняя упаковка и липидная структура! Тоже коллеги по цеху делали, молодцы!

Ответить
0
Развернуть ветку
TeslaCoil

Копец. И эта штуковина наделала себе друзяшек и устраивала в моем теле патихард пару недель назад.
Сейчас, наверное, тупой вопрос будет.
Это на помятую сферу цепляется какой-нибудь Hair с шариками и «коронами-палочками», которые и образуют в итоге поверхность? Или что-то более сложное?

Ответить
1
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Там модель составная - поверхность вируса это геометрия из X-Particles, белки большие распределены через MoGraph. Hair там я не использовал.

Ответить
2
Развернуть ветку
Тарп Хит

Хмм... 🤔
Знакомое лицо, где-то я его уже видел 😑

Ответить
1
Развернуть ветку
Молодой химик

У него еще есть индийский брат-близнец

Ответить
1
Развернуть ветку
Черри Бомб
Ответить
–34
Развернуть ветку
Молодой химик

Каеф. А я когда научкой занимался, только ссаные лизиновые дендримеры моделил

Ответить
1
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Ну все начинали с чего-то такого, я помню делал модель АТФ-синтазы со всеми белками и транспортом ионов. Сложно было очень.

Ответить
0
Развернуть ветку
Сергей Галкин

Мужчина, Вы - Крутой!

Ответить
1
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Спасибо!

Ответить
0
Развернуть ветку
Lumiere

Молодец 👍🏻 круто получилось 😎 Очень интересно почитать об этом, а то даже и не знал как оно делается)

Ответить
1
Развернуть ветку
Саша Косенко

Вот это работа у Вас!

Ответить
1
Развернуть ветку
LuNature

Прото малекула

Ответить
1
Развернуть ветку
Boruh Zackelberger

O, sweet summer receptor...

Ответить
0
Развернуть ветку
Ursus Mursus

Ты очень крут! Один из самых интересных постов на дтф за последний месяц или два.

Ответить
1
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Ну честно даже не думал, что такое будет интересно, спасибо!

Ответить
0
Развернуть ветку
Ult

Очень крутой рендер! Уважение!

Ответить
1
Развернуть ветку
Римус Люпин

низкий поклон

Ответить
1
Развернуть ветку
Smart Box

Как я помог исследователям увидеть тот самый коронавирус

Так вот из-за кого весь бардак начался.

Ответить
1
Развернуть ветку
Hariy Droband

Ну ты сукин сын

Ответить
1
Развернуть ветку
zabóta

На морскую мину больше похоже, а не на корону. Опять СМИ нас обмануло...

Ответить
1
Развернуть ветку
Suzume-sama said Xmas vibes

Ого, ты крут!

Ответить
1
Развернуть ветку
Александр Жохов

Молодец! Очень круто

Ответить
1
Развернуть ветку
Иван Куренский

Эх, тоже бы хотелось повоспроизводить его визуально, а не выделять его РНК из биоматериала тысячами в день=)

Ответить
1
Развернуть ветку
Jack O-Lantern

Круто! 👍 А этим можно тыкать в адептов, что вирус не выделен и его не существует??

Ответить
1
Развернуть ветку
Bill Bill

А какое у Вас образовнаие?

Ответить
0
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Основное - магистр по электроприводу и автоматизации промышленных систем и роботов.

Сейчас в планах еще закончить MBA и получить диплом по Data Science.

Ответить
1
Развернуть ветку
Dmitry Bulanov
Ответить
0
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Ну хватает на то, чтобы снимать дом в Калифорнии =)

Ответить
1
Развернуть ветку
Moon nut

А цвета выбраны для, красоты или у вируса такой окрас? У вирусов вообще есть цвет?

Ответить
0
Развернуть ветку
Молодой химик

Очень круто!

Ответить
0
Развернуть ветку
Sasha Grytsanchuk

Красота

Ответить
0
Развернуть ветку
Deomon

Ого очень круто.

Ответить
0
Развернуть ветку
misterXCV

Ничего себе! Это реально круто!
(скинешь проект C4D?)

Ответить
0
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Могу саму запеченную модель, если надо.

Ответить
0
Развернуть ветку
misterXCV

Не, модель не надо) Я просто хотел посмотреть как оно изнутри всё сделано, поэтому на всякий случай спросил, хотя ответ знал заранее. В любом случае, тебе огромный респект

Ответить
0
Развернуть ветку
Jhon Dou

А сколько моделька весит? -эх , кручу верчу, инвестора хочу.

Ответить
0
Развернуть ветку
Yuriy Svidinenko

Да после запекания очень немного, 20-30 мегабайт всего, я попозже сконвертирую и тут ссылку запощу.

Ответить
0
Развернуть ветку
Артём Тихонов

Круто!

Ответить
0
Развернуть ветку

Комментарий удален

Развернуть ветку
Alexander

Так и запишем: "напечатал коронавирус на 3D принтере"

Ответить
0
</