В общем на пиратке запустить игру с модами так и не получилось. Предыдущая сборка с горем пополам загружалась, а эта ни в какую. Версия 1.6.323.0. Эта ошибка ушла, но стал SKSE ругаться, что версия Ская не поддерживается. Вручную обновлял SKSE, но при запуске вновь накатывалась предыдущая версия и снова ругалась.
В итоге плюнул на все это дело и купить в Стиме Спешл с Анивёрсари. Накатил сборку и все заработало. Правда осталось непонятным. Получается, что моя AE работает с SKSE 2.0.20, хотя для нее делалась 2.1.03...