Кхм, ну я не знаю... Солид Снейк вполне заваривал чай с Мэрил об этом даже кодек есть в 4ой и диалог, что расстался с ней когда узнал, что ускоренно стареет. Ну и ещё были гэги как возможность залезть в МГС2 в шкаф с постером и передёрнуть. 

У Биг Босса все проблемы в конце третей МГС из-за бурной ночи с Евой так как та его раздела (под шумок кинув рацию в камин), измотала, цапнула Наследие Философов и сбежала в туман. Молчу про интим в коробке из Peace Walker. 

Данте тоже с сексом знаком (правда предохранялся в отличие от брата) согласно новелл к первым играм (часть канона - оттуда же Нэлли Голдстейн бабушка Нико и создатель его пистолетов, а также информатор Йензо - в Байонетте одноимённый информатор отсылка на оригинал) - Данте спал с девушками, но многие его чморили за то что он во сне звал мать (из-за понятно какой травмы дедства) - в итоге он малость потерял энтузиазм в этом плане. 

Вот Кирью и Леон это да с ними никаких упоминаний особо не было.