События «Pulse of Magic» разворачиваются в 2122 году. После прошедших катаклизмов, находящаяся под управлением технистов цивилизация смогла восстановить часть утерянных ресурсов. Были основаны колонии на Луне и Марсе, развитые технологии вновь вернули в жизнь людей долгожданный комфорт. Идиллию разрушило вторжение расы аррельзул, прозванной землянами «Превосходящие». Являясь биомеханоидами, аррельзульцы были способны встраиваться в системы и обходить щиты. Военные обратились к архивам и подняли информацию о магиках – идеологических оппонентах технистов, уникальных людях, способных использовать чуждую Превосходящим энергию. Начался отлов и отбор сильнейших кандидатов на роль солдат для спецотрядов. Пройдя испытания в симуляции под кодовым названием «Project:Madness», кандидат демонстрирует свою способность или не способность к выполнению миссии по защите Земли в реальных горячих точках. Главный герой – опытный боевой магик Рэмирус не стал противиться воле судьбы и бросил вызов симуляции, желая покончить с вторжением расы аррельзул раз и навсегда.