а какой проц?
а если попробовать в БИОСе принудительно 2му диску выставить Ген3 режим? Судя по мануалу (стр.23) и рэддиту в этой материнке возможна бифуркация ПСИ-линий, так что может как-то криво распределяет.
Тестил без САТА3 ССД?