У меня такая же фигня. Причём я не переходил из пиратки на стимовскую, а в пределах стимовской сейвы, сделанные ранее, тупо перестали загружаться. Ощущение, что сейвы ломаются из-за обновлений.

Теперь играю до момента сейва в самой игре, чтобы, если надолго в неё не поиграю, не начинать сначала.