В марвел то же самое. И масштабные вопросы про идиотскую логику "убить половину вселенной", и мелкие вопросы с конкретными сюжетными ходами.

Далеко ходить не надо - вот только что смотрел первую серию про Сокола: медийному лицу не дают кредит в банке. Да банк бы удавился, чтобы селебрити из Мстителей просто сфоткался рядом с вывеской - от клиентов отбоя не будет. 

Как я понял, Дарксайд тусит в какой-то альтернативной вселенной, где он "сидит на троне", а Степпенвулф как раз был в изгнании в нашей, поэтому и услышал коробки.
Судя по тому, как Степпенвулф и ДеСаад обсуждают видение Вульфа, они не застали события с фейлом Дарксайда, и вообще не знали, что коробки и уравнение как-то связаны. Они говорят о тех событиях, как о древней легенде, и не исключено, что воссевший на трон в другой вселенной Дарксайд немного изменил легенду, чтобы его последователи не знали, как он зафейлился тысячи лет назад. Потому что сейчас-то он более успешен, чем тогда, пусть у него и нет убер-уравнения.
Почему Дарксайд kinda forgot, где он зафейлился и потерял уравнение и коробки - непонятно. Может он и не забыл, а просто после фейла тупо боялся соваться на Землю. А всю эту легенду с потерянным уравнением развел, чтобы у его последователей была "великая цель" и предлог завоевывать миры. А теперь он, чтобы не потерять авторитет перед приближенными, вынужден превозмочь свои вьетнамские флешбеки и реально снова напасть на Землю.
Получается ментальная акробатика, конечно, но вроде более-менее объясняет что да как. Ну и Дарксайд так не просто злое зло, а злое зло с конфликтом.

Ну а коробок три - потому что это очень мифологичная цифра)

Почему за все это время не было предпринято хотя бы попытки узнать, а что там вообще с нашими коробкамиХороший кстати вопрос.)

¯\_(ツ)_/¯¯\_(ツ)_/¯¯\_(ツ)_/¯¯\_(ツ)_/¯¯\_(ツ)_/¯¯\_(ツ)_/¯¯\_(ツ)_/¯¯\_(ツ)_/¯¯\_(ツ)_/¯¯\_(ツ)_/¯¯\_(ツ)_/¯

Дарксайду дали пизды. Поэтому он ждал, пока там не кончатся всякие боги/зелёные фонари/криптонцы.