Есть вариант, что Индиана нужен ровным счётом для того что бы доставить ковчег альянсу.
Если бы его не было, то на место мертвых немцев, придёт другая разведгруппа, которая будет искать куда пропал отряд с ковчегом. Они его находят и ковчег забирают.