В новой части игры Лорд подземелья объединил под своим началом все силы тьмы и основал империю зла, а также переманил на свою сторону жрицу тёмных эльфов Талию. Теперь она выступает в роли главной помощницы Лорда — игроку предстоит взять её под контроль, возглавить силы зла и уничтожить обитающих на земле адептов добра. В Dungeons 3 игроку необходимо создать царство зла, состоящее из мрачных подземелий, хитрых ловушек и сложной инфраструктуры. Управлять предстоит орками, суккубами, зомби и другими монстрами.