На самом деле, в этом даже есть некие плюсы. Например, у меня есть Мибенд (браслет), который я настроил вибрировать при получении уведомлений с некоторых приложений (ВК в том числе). Но в самом ВК у меня стоят оповещалки на небольшую пачку пабликов. Однако мне никогда не хотелось, чтобы браслет реагировал и на эти паблики тоже, но исправить не мог (или всё, или ничего). С этим разделением на приложения можно будет настроить Мибенд так, чтобы он вибрировал на мессенеджер, но не на обычный ВК (т.е. реагировать только на сообщения, а не на паблики), что вполне неплохо звучит.