На второй биоме отъехал не дойдя до босса. И че вы думаете? - снова от корабля начало.

Добро пожаловать в жанр роглайт, в этом и есть суть

Собственно вопрос, если вот так сейвскамя и не умирая, пройти всю игру, будут ли какие то упущения сюжета

Да, между ранами можно побродить по больничным воспоминаниям