Действие Resonance of Fate разворачивается в далёком будущем, где человечество оказалось на грани уничтожения, и лишь у некоторых героев есть шанс его спасти. В центре сюжета — троица персонажей, наёмники Ваширон, Зефир и Лиан, выполняющие поручения для местных кардиналов. Одна из ключевых особенностей игры — система боя на гексагональном поле, завязанная на тактическом перемещении.