Да, отнимаются. За преступления и не только. Нет, сознание никуда не исчезает, они не умирают, оно хранится, собственно сам Ковач в первой книге так и оказался на Земле. И да, клоны существуют, и более того "крутые" тела активно производят, это продукт биотеха и конкуренции. У Ковача будет такое тело во второй книге. В той вселенной довольно таки сложно умереть, главное сохранить стек.