В Hacknet игроки должны управлять действиями героя с помощью комбинации графического интерфейса ПК и текстовой консоли, при этом они взаимозаменяемы. Суть игры состоит в подключении к другим компьютерам и запуске на них специальных программ для нарушения работы систем безопасности. Сначала нужно просканировать «жертву», а уже потом выбирать подходящий в каждой конкретной ситуации способ взлома. Цели и задачи в каждой миссии меняются, заставляя использовать разные инструменты.