Там было, по сути, три сюжетки в зависимости от того, насколько хорошо ты игру проходишь.
Чем больше завалил заданий в начале и чем хуже ты по местной шкале морали, тем меньше глав тебе будет доступно после определенных моментов (5, 7 и 9, если память не изменяет).
Причем в каждой варианте прохождения свои уникальные сюжетные задания и концовки.