Конечно, я так и играю. Сначала установите стимовскую версию игры, потом удалите все файлы из папки ...Steam\steamapps\common\Morrowind
запустите инсталлятор и укажите ее в качестве каталога установки. Все.
Но старые сейвы вряд ли подцепятся если что. Игру придется начинать заново.