Более того, Архитектор объясняет Нео, что он — носитель «элементарной программы», суммы всех аномалий системы. И когда Смит возрождается, он тоже обладает элементарной программой, Нео передал её ему в предыдущей битве. Нео, получается, «отец» Смита. Кто тогда мать? В «Матрице: Революция» Смит сам даёт ответ на этот вопрос: он называет «мамой» Оракула, намекая, что именно она создала его и вернула в Матрицу.
В том, что Смит мог изменять Матрицу по своему желанию, сомнений нет. Его битва с Нео в «Революции» показывает, что способности Смита гораздо более внушительны, чем у лже-Избранного, который умеет только летать и драться.
И именно благодаря Смиту Матрица была разрушена, а война — окончена. Конечно, это Нео заключил сделку с машинами, но без тех катастрофических разрушений, которые нанёс Матрице Смит, машины вряд ли бы согласились. Нео был необходим, чтобы перезагрузить Матрицу и избавиться от вируса-Смита.
В последней сцене «Революции» Архитектор говорит Оракулу: «Ты затеяла очень опасную игру». Оракул убедила всех в том, что Избранный — это Нео, когда всё это время им был Смит. Она обманула всех: людей, машины, самого Смита и нас с вами.