Максимально без спойлеров. Написал так, чтобы родить интерес к просмотру. 

Два дня назад разом просмотрел из-за @Andrey Apanasik 
Correct me, if I'm wrong. 
Хоть аниме и вышло раньше игры, советую пробежаться глазами по доступному материалу о игре.  Если поставить игру по хронологии перед сериалом, то картина несколько целостнее выглядит. 

Само аниме - размышление на тему существования интернета, как отдельного пространства, отдельного мира, а не очередной комнаты в помещении. Возможность человека пребывать в двух местах одновременно, не перемещаясь. 

Если не понятно каким образом возможен главный сюжетный поворот, связанный с героиней - серия про конспирологию ближе к концу. У Земли есть своя естественная звуковая частота, у линии электропередачи своя. Поверх этого натягиваем то, что звуки влияют на сознание, как было показано вроде как в том же эпизоде и бум. Главный сюжетный поворот.