А на втором, максимум, парочка новых альтернативных миссий будет.Фазы 4, 6-8 полностью другие(за исключением моментов когда герои в них пересекались), 1-3 и 9 частично другие. Фаза 4 за Юито=Фаза 5 за Касанэ. События и некоторые моменты показаны с перспективы другого персонажа. Например про эксперименты у одного персонажа упоминают, а у другого вполне показывают результат.