Я пыталась выпендриться и сделать в Scrivener, но в итоге старый добрый Word) Потому что Scrivener типа удобный тем, что можно сделать себе доску и все заметки и ресерч пихать в один проект, но это платная программа, она делает странные резервные копии в миллион штук на компе, и вообще. В ворде есть все, что надо :)