Прорисованные глаза нужны в первую очередь для выражения эмоций. А поскольку профессор подавляющую часть времени спокоен (в отличие от Катриель), то ему и глаза прорисовывать нет нужды.

"у них" в смысле у профессора с дочерью, или вообще у персонажей?)

в любом случае, графический стиль серии очень своеобразен, и не в последнюю очередь из-за отличительных особенностей лиц. глаза это просто одна из таковых особенностей, вот и все)