Несмотря на гигантский прогресс, который достигла атомная физика за более, чем столетнюю историю, графического представления для атома лучшего, чем планетарно-аскорбинковое, пока ещё не придумано. Ибо волновую функцию только в одномерном случае можно мало мальски адекватно отобразить, что уж там про 3D говорить. Именно поэтому эти шарики в роли элементов атома вы можете встретить даже в свежем выпуске Nature или PRL.