Front Mission 3 является пошаговой тактической игрой с видом сверху. Управляя четырьмя роботами, мы будем сражаться на небольших аренах против различных противников, чаще не больше шести штук одновременно. Ваш ход делится на передвижение и атаку. Последнее завершает раунд.
Юниты ходят по очереди, поэтому если вы или противник остались одни, то будете стрелять после каждого хода.

Между миссиями мы можем покупать улучшения и части роботов, заходить в интернет и симулятор, где мы можем обкатывать и тестировать новое оружие, ванзеров и получать за это опыт. А ещё можем пользоваться игровой электронной почтой и общаться с персонажами.
Весь сюжет подаётся в виде текста с портретами персонажей на фоне простеньких локаций.