Гибернировал компьютер, к которому был подключён внешний USB-винт, прямо с открытой папкой с файлами. Подсоединил к другому ПК, что-то делал с этими файлами, вроде просто добавил новые. Обратно подсоединил к первому и включил - Винда удалила эту папку и ближайшие. Восстанавливал утилитами и не уверен, что смог все.
Не помню, это была XP или Семёрка, может этот баг всё ещё есть.